Если проект был утвержден без проекта квартир на техническом этаже, то это то же самое, как вы у себя в жилье делаете перепланировку. Можно согласовать и позже. Можете успокоить себя тем, что при протечке крыши, а она обязательно со временем произойдет, с ведрами и тазиками будут бегать жильцы чердака, а не вы.