Интересовался этой темой, и насколько я понял, перемерять квартиру могут только БТИ, а они выезжают на замер до получения собственности только если подать в суд на застройщика.
Застройщик тут как бы не при делах. Он даже не выбирает, какая организация ПИБовская будет производить обмеры. Застройщик не имеет права оспаривать их обмеры. Вы же, оспаривая, должны возражать не застройщику, а обмерщикам. Т.е. принимаете квартиру как есть, а потом как собственник вызываете независимого эксперта и подаете в суд на организацию, проводившую первоначальные замеры.
Однако, прежде убедитесь, что вас действительно обманули. Обмерщиков лишат лицензии, если вы докажете их "ошибку", поэтому в наглую они не ошибаются. Обычно в пределах допустимой погрешности.