В договоре с каждым конкретным застройщиком свои правила на этот счет. Раскройте ваш договор и пытайтесь понять. Обычно считается, что при разнице до 1 квадратного метра претензий нет, а если разница больше, то все квадратные метры лишние нужно оплатить.